Las áreas de trabajo son las secciones temáticas en las que se organiza la Federación Murciana de Asociaciones de Estudiantes, de las que se encarga la Junta Directiva y participan las asociaciones miembro en el marco de todas las acciones y actividades de FEMAE.
Área de Participación y Promoción Asociativa
Atiende el contacto más cercano con las asociaciones de estudiantes, desde su creación hasta su desarrollo y pleno funcionamiento. El objetivo de esta es el asesoramiento, la formación y la creación de una red regional de asociaciones de estudiantes. De igual modo, se encarga de la redacción y elaboración de notas de prensa, campañas publicitarias y gestión de las redes sociales de la organización.
Área de Incidencia Política
Elabora las propuestas de FEMAE sobre educación y juventud, así como las decisiones de la Federación en los órganos donde está presente. De este modo, lidera la incidencia política y las relaciones con otras entidades del ámbito educativo o juvenil, además de la relación con la Administración y los partidos políticos.
Área de Infancia
Analiza la situación de la infancia en nuestra Región, tanto en el sistema educativo como fuera de este y desarolla posicionamientos y propuestas para la mejora de la situación y la defensa de sus derechos. Además de gestionar la participación de FEMAE en organizaciones como la Plataforma de Organizaciones de Infancia de la Región de Murcia.
Área de Diversidad e Inclusión
Comprende desde la prevención y actuación frente al acoso escolar hasta la inclusión de temas sociales transversales en la educación como la segregación social, la diversidad funcional, el feminismo o el movimiento LGTB+.